《狙击手幽灵战士》的故事发生在一个叫做Isla Trueno的南美小岛上。岛上的Vasquez将军率领其军队推翻了当地民主政府，用暴政控制整个小岛。而玩家作为秘密突击队的一员，需要潜入敌军的大本营，一举推翻这个不合法的政府。

可靠消息称，Vasquez将军将在一个旧的精炼厂中与他的同伙们举行一个会议，而这也将是进行暗杀的绝佳机会。但是就当突击队到达了这个小岛的时候，整个计划都已经乱套了。突击队成员们需要运用自己卓越的战斗技巧和高超的求生能力完成任务。

像许多表现狙击手类的游戏一样，《幽灵战士》也提供了一个“聚焦模式”，激活这个模式之后时间会放慢，并会高亮潜在的目标。在紧要关头时这个模式非常好用，特别是当敌人在较远处时。

同时，角色的呼吸也会影响到射击的效果。如果本次射击瞄准的好的话，镜头会切换至“子弹时间”效果，镜头会随着子弹一直走，直至击中目标。这样的设计非常受大家的喜欢，尤其是那些享受在第一人称射击中进行狙击的玩家们。